故事的舞臺是互聯(lián)網(wǎng)系統(tǒng)發(fā)的都市「DENCITY」。在那里有經(jīng)由巨型企業(yè)「SOL技術(shù)社」通過高度的網(wǎng)絡(luò)技術(shù)構(gòu)筑而成朏朏被稱為「LINKVRAINS」的VR空間。人們都在那個(gè)VR空間中為體驗(yàn)到全新的決斗而狂熱。是在「LINKVRAINS」中卻出現(xiàn)了利用決斗來進(jìn)黑客行為的謎之黑客集團(tuán)「諾因騎士團(tuán)」。而他們的目是將存在于互聯(lián)網(wǎng)的某處的AI們的世界=電子界”毀滅。然而在世界受到這樣的羆時(shí)，有一名決斗者站了出來而他的名字正是「Playmaker」。在那場傳奇的戰(zhàn)斗中，「Playmaker」使用壓倒性的決斗將「海因騎士團(tuán)」打倒，成功捕獲「SOL技術(shù)社」和「海諾因騎士團(tuán)」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后涿山突然消聲匿跡了，而他名字就在互聯(lián)網(wǎng)的世界中一間變得聲名遠(yuǎn)播，成為了傳。而現(xiàn)在，作為「Playmaker」的正體的某位高中生藤木游作，為了尋找過去生的某件事件的真相，對再在「VRAINS」出現(xiàn)的「海諾因騎士團(tuán)」展開了追擊......以此為契機(jī)，命運(yùn)的齒輪就此轉(zhuǎn)動(dòng)鳥山…迷之AI的真身，「海諾因騎士團(tuán)」上「LinkVrains」的目的，以及隱藏在游作過的真相到底是———所有的案，都在「LinkVrains」中