在代歐奇希斯以下代歐）變防御型態(tài)與裂坐持續(xù)激戰(zhàn)的時(shí)，拉魯斯市播系統(tǒng)昭告大緊急避難。市們聽到廣播后驚慌疏散。代此時(shí)又變成攻型態(tài)，并對(duì)裂坐釋出攻擊。播持續(xù)呼吁民這并非演習(xí)，小超則在逃竄的人群當(dāng)中，惑不解為何代還活著。當(dāng)小在避難時(shí)遇見(jiàn)只難過(guò)的正電拍。小超一看神奇寶貝頓時(shí)壞了，但聽到的求救聲便鎮(zhèn)下來(lái)。原來(lái)它同伴負(fù)電拍拍陷進(jìn)垃圾桶里法掙脫，小超定幫忙。當(dāng)他開垃圾桶蓋時(shí)忽然負(fù)電拍拍不及待地沖出！小超又嚇壞，不由自主地要逃離現(xiàn)場(chǎng)，時(shí)忽然小卡比也從垃圾桶冒來(lái)！可憐的小就這么昏過(guò)去。之后小智趕發(fā)現(xiàn)不省人事小超，便用盡法想把小超叫。小超蘇醒后不高興地嫌小多管閑事（背的小卡比獸則著垃圾吃）。時(shí)小遙、小剛正太、阿隆、位女性和兩位胞胎女生也趕，而小智正催小超趕快逃難但小超還來(lái)不動(dòng)作，忽然一死光射到他們近的地面，把家嚇得魂飛魄！大家驚魂甫時(shí)，小超告知個(gè)地方可以躲，一行人便跟過(guò)去。 小超帶大家來(lái)到他之去的玻璃溫室物園。當(dāng)小超植物園的入口卡機(jī)刷卡時(shí)，現(xiàn)讀卡機(jī)故障門打不開了。太自告奮勇地雙手奮力把門開。當(dāng)大家為太喝采時(shí)，阿盯著小智看，蔑地說(shuō)小智怎還待在拉魯斯里，以為他慘后早該羞愧地老家了。小智氣地說(shuō)要再跟比一場(chǎng)，小遙得勸架說(shuō)現(xiàn)在是時(shí)機(jī)，但這一旁的兩位雙胎女生加油添地說(shuō)她們的哥絕不會(huì)輸給小。小智質(zhì)問(wèn)她是誰(shuí)，而那位性解釋那兩位女生是正太的妹們，オオド（暫：大鳥）キャサリン（：凱薩琳）。性則自我介紹ヒトミ（暫：瞳）。接下來(lái)們都知道小剛做出什么反應(yīng)，而小勝也立拉走小剛的耳。 之后阿隆問(wèn)大家該如何在物園里打發(fā)時(shí)，而小瞳則拿筆記型電腦開查詢那只DNA神奇寶貝的資。但出乎她意之外并沒(méi)有任代歐的資料，太則催促她繼嘗試（背景的卡比獸正在睡）。此時(shí)小智問(wèn)一臉哀傷的超怎么了，而其他人的關(guān)切，小超開始訴他四年前的經(jīng)。小超仰望著在激戰(zhàn)的兩只奇寶貝，在大（除了小卡比）的全神貫注，說(shuō)代歐是從宙來(lái)的。四年一顆隕石擊中表，而從隕石，迸出那只被多博士命名為代歐奇希斯”神奇寶貝。由它侵犯了裂空的大氣層領(lǐng)域于是大激戰(zhàn)開。裂空坐的破死光之后準(zhǔn)準(zhǔn)轟碎代歐奇希，成為零星碎。阿隆對(duì)小超故事懷疑并嗤以鼻，而正太叫小超別把他當(dāng)小孩騙，并問(wèn)為何代歐現(xiàn)還活著？小超能回答他不知。 此時(shí)在溫室植物園苦山空，歐開始復(fù)制自的“影子代歐分身。分身群看到四處躲藏驚慌市民，居就開始沖下來(lái)擄走市民到不名的地方去了 在植物園中小智他們?nèi)越瀚C獵瞳的電腦收聽播。記者播報(bào)在拉魯斯市被?\罩在代歐所形成的透明罩里法對(duì)外通行，且影子代歐們仍不停地?fù)镒?們。小瞳關(guān)掉腦，正太則擔(dān)被困在這里。窗外的影子代群不時(shí)地逼近把大鳥和凱薩嚇哭了。忽然只分身沖破玻屋頂進(jìn)來(lái)，小看到趕緊叫大趕快跑，但影代歐卻已經(jīng)沖來(lái)了！正太叫水箭龜用高壓浦，卻對(duì)影子歐無(wú)效。就在太納 悶為何無(wú)效的時(shí)候，從后另一只影子歐偷襲正太和箭龜，從屋頂洞把他們擄走！阿隆生氣地出火焰雞使出焰飛踢，小智皮卡丘用十萬(wàn)特，小瞳叫出金怪用彗星拳雙胞胎叫出溜糖球和雨翅蛾泡沫光線。這神奇寶貝在對(duì)影子代歐群時(shí)小智叫大家趕逃走，阿隆則小超是否知道急出口在哪。然小剛發(fā)現(xiàn)他寶貝球無(wú)法打了，其他人也覺(jué)他們的也不。 影子代歐又殺出重圍逼近超，害他只好續(xù)逃躲。阿隆火焰雞攻擊影代歐，并叫大別管他而先行離。阿隆請(qǐng)小照顧好他的兩妹妹，但小遙想丟下阿隆不。此時(shí)小剛正急地想叫醒小比獸（居然到節(jié)骨眼還在睡，而火焰雞持使出上勾拳拖時(shí)間，讓小遙們有時(shí)間跑到口。小遙叫正戰(zhàn)斗的小智他趕快跑過(guò)來(lái)，小智他們還是咐小遙她們先離開。忽然，卡比獸打了大的呵欠，同時(shí)里冒出白光照整個(gè)溫室，居把所有影子代給光分解了！智他們便趁機(jī)向出口離開。 此時(shí)在倫多博的研究實(shí)驗(yàn)室，倫多博士不人事地躺平。手春野手持電棒，嘴里假惺地感謝倫多博的努力帶給他少的方便，忘地盯著水晶球，幻想自己能何地從中獲得利和權(quán)勢(shì)并掀神奇寶貝界的革命。這時(shí)忽有人敲門把春嚇了一跳。原外面是小超和行人，小超則一行人解釋實(shí)室是建造在植園的底下。春這時(shí)開門讓大進(jìn)去，但實(shí)驗(yàn)里都不見(jiàn)倫多士的人影。小問(wèn)春野父親的落，春野騙說(shuō)多博士已經(jīng)出找他了。小超心外面那么危爸爸會(huì)不會(huì)有，春野則叫小不要窮擔(dān)心。智打算出去尋博士，但阿隆叫小智不要貿(mào)行動(dòng)造成大家擔(dān)心。一群人待在一起等倫博士回來(lái)。 已經(jīng)晚上了，卻不見(jiàn)倫多博士蹤影。大鳥和薩琳一直喊累餓，阿隆只好她們安靜再等下。此時(shí)小卡獸手拿著三明走向大鳥和凱琳，那對(duì)雙胞以為這只好心神奇寶貝帶給們食物，卻看小卡比獸當(dāng)面三明治吞掉了兩個(gè)女生頓時(shí)哭，小智則決要出外找食物阿隆仍是提醒智外面的危險(xiǎn)但這次小智毅地跑出去，阿和其他人只好隨。 在外頭可看到影子鬲山歐處飄移，如同巡邏一般。小他們放低姿態(tài)免被發(fā)現(xiàn)，并起計(jì)畫找尋食大作戰(zhàn)。當(dāng)影代歐暫時(shí)離開大伙便分頭行，而小智、皮丘和小剛找到一臺(tái)熱狗販賣，但電源切斷。小智叫皮卡使出十萬(wàn)伏特那臺(tái)電動(dòng)販賣便一邊啟動(dòng)一播放音樂(lè)，熱不停地掉出來(lái)小剛他們就盡能地抓了一大。忽然，小剛小智壓在地上并叫他不要出，原來(lái)頭頂上著一群影子代。小智他們躲販賣機(jī)后面，機(jī)器的音樂(lè)卻在播放！影子歐聽到音樂(lè)后販賣機(jī)逼近，智他們則嚇得為死定了。忽小超和正、負(fù)拍拍從另一頭出來(lái)，完全不道影子代歐的在。分身們立沖向小超，但、負(fù)電拍拍聯(lián)用了電擊絕招護(hù)小超。這時(shí)一只影子代歐地攫住負(fù)電拍和小超！小智奮不顧身地抓那只分身并猛它的一只手臂小超便掙脫成了。小智問(wèn)小是否安然無(wú)恙皮卡丘則持續(xù)擊其他分身。為數(shù)實(shí)在太多，小智叫大家快逃離，但小仍擔(dān)心負(fù)電拍的安全。小剛吁他們自身的全更重要，于他們便逃離現(xiàn)了。他們來(lái)到間開著窗戶的筑物，于是便進(jìn)窗戶躲藏。子代歐群飛掠來(lái)，幸好沒(méi)有現(xiàn)小智他們的跡。在稍微喘后，小超發(fā)現(xiàn)電拍拍為它的伴難過(guò)，便試撫摸安慰正電拍，卻因?yàn)橛?創(chuàng)傷的身體排反應(yīng)讓他無(wú)法么做，只好對(duì)電拍拍道歉。時(shí)皮卡丘在這建筑里找到一水，讓大家心好了起來(lái)。 之后大家費(fèi)了一力氣回到實(shí)驗(yàn)，并一面吃著狗一面稱贊多吃。此時(shí)阿隆著小瞳的電腦播，告訴小智些被影子代歐走的人們（包火箭隊(duì)…和可鴨）都被帶到知名的地方。剛對(duì)那個(gè)特定方感到奇怪，時(shí)忽然聽到倫博士的聲音！來(lái)他從柜子里沈地爬出來(lái)，然不知道自己電昏的事情。士說(shuō)代歐正在它的朋友，并大家春野在哪。大家說(shuō)春野去了，博士環(huán)四周發(fā)現(xiàn)水晶體不見(jiàn)了。小問(wèn)父親那是什，倫多博士則答，那球體是歐奇希斯的另部份身體。之博士透露原來(lái)球體就是讓代再生、復(fù)制的鍵！小勝告知野帶著球體離了，阿隆則猜原來(lái)代歐就是了找回這球體返回攻擊大家。 忽然，之前在植物園里的秘光芒又出現(xiàn)小超面前和他談話”。小超大家介紹這是在植物園認(rèn)識(shí)朋友，之后那芒形成另一只歐奇希斯的身。小超告訴父或許水晶球體有生機(jī)，便沖去尋找，后面著其他人。 此時(shí)在拉魯斯市偏僻處，春野著一只箱子瘋地跑。忽然從只神寶的戰(zhàn)斗射來(lái)一束死光在附近的地面炸讓春野失去心并摔倒箱子出水晶球體。炸引發(fā)的碎石始落向春野，這倫多博士的手就被掩埋了在天空中的兩神奇寶貝也沒(méi)著，裂空坐開用身體緊纏代，讓代歐無(wú)法彈。 小超后頭跟著其他人，由那個(gè)光芒的領(lǐng)下繼續(xù)向前。小超現(xiàn)在了為何代歐奇希不想要孤獨(dú)，感同身受地決要成為代歐的友。其他人也定幫助小超停裂空坐與代歐爭(zhēng)。此時(shí)春野脫瓦礫堆，一咒罵水晶球體來(lái)他的麻煩。野這時(shí)困惑地尋水晶球體的落，但立刻信旦旦地自信一能很快找到。拿出遙控器按鈕，激發(fā)不遠(yuǎn)的水晶球體射強(qiáng)光。在天空，被裂空坐纏的代歐往下看晶體，臉上頓露出憤怒的表?；氐降厣?，導(dǎo)小超的光芒往水晶球體發(fā)的強(qiáng)光接近，智則興高采烈說(shuō)找到了。阿覺(jué)得奇怪為何晶球體會(huì)發(fā)出光，大家便蹲來(lái)端詳。此時(shí)野出現(xiàn)說(shuō)水晶體是他的，并手準(zhǔn)備拿的時(shí)，一群影子代過(guò)來(lái)把春野包住了。阿隆認(rèn)它們也是要來(lái)水晶球體，此小智決定，這要幫助春野…?